Школа179

Просмотр кода страницы Биоинформатика страница

**Преподаватель:** Елена Шушкевич (tg: @ElenaShush, e-mail: eshushkevich@yandex.ru).

**Когда:** среда, после уроков **(!)**. Спецкурс совмещён с кружком и проектной парой 10-х классов.

===Описание курса===
В последние десятилетия биологическая наука пережила настоящую революцию. Всё началось с появления технология секвенирования — метода, позволяющего «прочитать» генетическую информацию, хранящуюся в клетках живых организмов. Это открытие открыло совершенно новые возможности в изучении жизни.

С каждым годом объём генетических данных стремительно растёт. Для их обработки потребовались специальные методы — статистический анализ и программирование. На стыке этих дисциплин возникла новая научная область — биоинформатика.

На нашем курсе вы освоите основные этапы работы с генетической информацией. Мы подробно разберем процесс секвенирования ДНК, а также методы визуализации и анализа полученных данных.
 
Программа обучения включает:
- Первичный анализ — проверка качества секвенирования
- Сборка генома из отдельных фрагментов ДНК
- Аннотирование генома — определение местоположения генов и их функций
- Практическое исследование генов цикла Кальвина
 
Далее в курсе вы освоите методы сравнительной геномики. Вы научитесь:
- Находить родственные гены с помощью программы BLAST
- Разбираться в различных алгоритмах выравнивания генов и построения филогенетических деревьев
- Строить филогенетические деревья
- Решать прикладные задачи (найдём ближайших сухопутных родственников китов и проверим, действительно ли киты относятся к млекопитающим, а не рыбам)
 
В заключительной части курса мы перейдем к изучению микробиомов. Вы освоите методы сравнения микробных сообществ и сможете принять участие в исследовательском проекте по анализу микробиомов северных морей России.
 
Курс сочетает теоретические знания с практическими навыками.