Если вы собираетесь заниматься этим проектом, присоединяйтесь к
((https://t.me/+p2ts3O-f0iVkOTdi чатику)).
Сложный непонятный проект! Я сам не знаю, что получится и получится ли
что-то!
Я предлагаю делать новые вещи, поэтому не гарантирую успеха. С другой
стороны, возможно что-то из этого было сделано. Так что гуглите,
используйте опыт предшественников!
Сначала разберитесь (и объясните мне) с Langton's loop —
клеточным автоматом, где возможно репликация, посмотрите на аналоги.
https://en.wikipedia.org/wiki/Langton%27s_loops
Для симуляции клеточных автоматов есть программа Golly
https://golly.sourceforge.io/
После этого попробуйте придумать клеточный автомат, в котором сложные
структуры чинят себя после небольших случайных изменений (например,
состояние одной клетки изменилось). Сначала можно придумать клеточный
автомат, в котором стабильные структуры устойчивы себя, а потом — в
котором есть интересная динамика. Научитесь симулировать клеточные
автоматы со случайными изменениями (в golly, если это возможно). Было
бы очень классно придумать клеточный автомат, в котором сложные
структуры реплицируются и устойчивы к небольшим изменениям —
исправляют себя или продолжают работать несмотря на них.  
Одна из опций — сделать непрерывные состояния, например, состояние —
действительное число или несколько чисел.
Дальше есть очень сложные, но очень интересные задачи. Можно
попробовать сделать системы, которые регенирируют после того, как
отрезали / поломали большой кусок. Другая далёкая цель — сделать
клеточный автомат, в котором возможна эволюция: в результате мутаций
"существа" становятся более стабильными или даже более
приспособленными к чему-то. Ещё одна большая задача — создание
конструкций, которые стремятся к какой-то цели, могут идти к ней
разными путями. Ещё раз повторю, что это безумно сложные задачи,
которые вряд ли получится решить, но любой прогресс интересен.
Ещё одно интересное свойство клеточных автоматов, которое можно
добавить — сохранение массы (энергии, чего-то ещё). Можем обсудить,
почему это интересно.
Другой сюжет, который может кого-то заинтересовать — клеточные
автоматы на гиперболической плоскость, вот симулятор
https://dmishin.github.io/hyperbolic-ca-simulator/help.html

=={{anchor href="bio"}}Этюды из геномной биоинформатики. В.
Е. Раменский, Руслан Салимгареев== 

=={{anchor href="kal"}}Ю.В. Калугина. Ждём анонса==

Сложный непонятный проект! Я сам не знаю, что получится!

Проект рассчитан на слушателей, не имеющих специальной подготовки,
кроме школьных уроков биологии. Биоинформатика — раздел молекулярной
биологии, связанный с анализом и обработкой данных, — представлена
несколькими направлениями, среди которых биоинформатика
последовательностей, структурная биоинформатика, системная биология.
Цель нашего проекта — освоить основные инструменты работы с
биоинформатическими данными через небольшие практические задачи, в
основном будет затронута биоинформатика последовательностей. Поработав
над этим проектом, вы сами сможете найти последние научные данные про
любой интересующий вас ген или белок и даже провести несложный анализ
их свойств.
Проект начнётся с вводной лекции по основам молекулярной биологии и
биоинформатики. Затем вам будет предложено несколько небольших
биоинформатических кейсов. На защите нужно будет рассказать, чем вы
занимались и чему научились, так, чтобы слушатели без биологической
подготовки это поняли — а это не так просто, как кажется!
Кто-то из команды должен будет программировать. Кто-то другой может
ставить эксперименты почти без программирования, но совсем без
программистов не получится. Но какие-то невероятные навыки
программирования не нужны.

  * Важное отличие игры жизнь от настоящей жизни состоит в том, что,
если чуть-чуть повредить вас, вы этого не заметите, а конструкция в
игре жизнь рассыплется. Я предлагаю посмотреть, что будет, если
добавить в клеточные автоматы чуть-чуть шума -- иногда случайно
переключать клетки. Сначала нужно разобраться с клеточными автоматами,
как в предыдущем пункте. Возможно, получится что-то интересное, но не
обещаю.

https://t.me/russal2010